Основной областью применения льноватина является возведение деревянных домов и бань, так называемых «срубов». Его используют в качестве межвенцового утеплителя (теплоизоляционного слоя между брёвнами). Наибольшая эффективность этого материала достигается при одном условии: если здание строится из строганного или шпунтового бруса. Тогда, за счёт ровной поверхности на всём протяжении межвенцового стыка, удается добиться практически полной изоляции.